Ο κορωνοϊός και οι οικονομικές επιπτώσεις που προκάλεσε, έβαλε στον πάγο για έξι μήνες τους συμψηφισμούς που αφορούν πληρωμές και οφειλές προς το κράτος και αντίστροφα. Λόγω της οικονομικής κατάστασης που επέφερε η πανδημία, η Γενική Λογίστρια της Δημοκρατίας Ρέα Γεωργίου, έδωσε οδηγίες στο προσωπικό του λογιστηρίου όπως ανασταλεί η διαδικασία συμψηφισμών μέχρι την 30ή Σεπτεμβρίου.
 
Οι συμψηφισμοί γίνονται όταν κάποιο πρόσωπο έχει οφειλές προς το κράτος και παράλληλα διεκδικεί από τα κυβερνητικά τμήματα πληρωμές. Κάθε χρόνο, σύμφωνα με στοιχεία του Γενικού Λογιστηρίου, οι συμψηφισμοί γίνονται για οφειλές προς το Ταμείο Κοινωνικών Ασφαλίσεων, το Τμήμα Φορολογίας, το Τμήμα Πολεοδομίας, το Τμήμα Αναπτύξεως Υδάτων και προς το Κτηματολόγιο. Επίσης, οι συμψηφισμοί αφορούν το Γενικό Λογιστήριο, το Τμήμα Δημοσίων Δανείων, το Τμήμα Τελωνείων και τις υπηρεσίες δημόσιας υγείας.
Σύμφωνα με στοιχεία του Γενικού Λογιστηρίου, τον Μάρτιο και τον Απρίλιο, πραγματοποιήθηκε μικρός αριθμός συμψηφισμών, οι οποίοι μάλιστα αφορούσαν πράξεις προηγούμενων μηνών. Ενδεικτικά είναι και τα στοιχεία του Γενικού Λογιστηρίου, σύμφωνα με τα οποία τον Μάρτιο έγιναν 1.452 συμψηφισμοί ύψους €2,6 εκατ., ενώ τον Απρίλιο ο αριθμός των συμψηφισμών μειώθηκε περαιτέρω. Συγκεκριμένα, έγιναν 444 συμψηφισμοί ύψους €696 χιλ. Πέρσι τον Μάρτιο πραγματοποιήθηκαν 1.419 συμψηφισμοί ύψους €3,1 εκατ. και τον Απρίλιο 1.477 συμψηφισμοί ύψους €3,4 εκατ.
 
Από την ανάλυση των στοιχείων του Γενικού Λογιστηρίου διαφαίνεται πως τους πρώτους τέσσερις μήνες του έτους πραγματοποιήθηκαν 4.041 συμψηφισμοί ύψους €8,8 εκατ. σε σχέση με €13 εκατ. την αντίστοιχη περσινή περίοδο. Αξίζει να σημειωθεί πως οι  συμψηφισμοί άρχισαν να εφαρμόζονται από το τέλος Ιουλίου του 2014 στο πλαίσιο της εφαρμογής της νομοθεσίας περί της Λογιστικής και Δημοσιονομικής Διαχείρισης και Χρηματοοικονομικού Ελέγχου της Δημοκρατίας. Μέχρι την 30ή Απριλίου του 2020 έχει συμψηφιστεί συνολικό ποσό ύψους €258,8 εκατ. Από το σύνολο, ποσό ύψους €119,1 εκατ. αφορά συμψηφισμούς προς το Τμήμα Φορολογίας, ποσό ύψους €82,6 εκατ. προς το Ταμείο Κοινωνικών Ασφαλίσεων, και ποσό ύψους €57,1 εκατ. αφορά συμψηφισμούς προς τα υπόλοιπα κυβερνητικά τμήματα/υπηρεσίες.
Ψαλίδι σε μισθούς και συντάξεις 
Βάσει της σχετικής νομοθεσίας το Γενικό Λογιστήριο, στο πλαίσιο των συμψηφισμών, έχει το δικαίωμα να αποκόπτει τους μισθούς και τις συντάξεις των κυβερνητικών λόγω των εκκρεμούντων ενταλμάτων που είχαν οι οφειλέτες προς τη Δημοκρατία. Εκτιμάται πως από τον Ιούλιο του 2014 οπότε τέθηκε σε εφαρμογή ο νόμος, οι αποκοπές από τους μισθούς, τα ωρομίσθια και τις συντάξεις των κυβερνητικών ανήλθαν στις €851 χιλ.
Στα €56,3 εκατ. οι συμψηφισμοί πέρσι 
Στο μεταξύ, σύμφωνα με τα στοιχεία του Γενικού Λογιστηρίου πέρσι πραγματοποιήθηκαν 18.154 συμψηφισμοί εσόδων και χρεών ύψους €56,3 εκατ. Το 2018 έγιναν συνολικά 15.133 συμψηφισμοί για ποσά €50,9 εκατ., το 2017 14.210 συμψηφισμοί για ποσά €34,7 εκατ. και το 2016 13.308 συμψηφισμοί για ποσά €33,8 εκατ. Επίσης, το 2015 έγιναν 11.337 συμψηφισμοί ύψους €38,1 εκατ., το 2014 ο αριθμός τους ήταν στις 4.080 και το ποσό στα €33,8 εκατ. Το Γενικό Λογιστήριο τέλος του 2013, πριν ακόμη εφαρμοστεί ο νόμος, προχώρησε σε 27 συμψηφισμούς ύψους €2 εκατ.