Αποτροπιασμό προκαλούν τα αλλεπάλληλα ψυχολογικά και σωματικά βασανιστήρια που υπέβαλαν για ένα χρόνο στον Βαγγέλη Γιακουμάκη οι συμφοιτητές του, τα οποία έβγαλε στο φως το κατηγορητήριο της υπόθεσης.
 
Όπως προκύπτει, ο 20χρονος φοιτητής της Γαλακτοκομικής Σχολής Ιωαννίνων, ο οποίος εξαφανίστηκε στις 6 Φεβρουαρίου του 2015 και βρέθηκε νεκρός περίπου ένα μήνα αργότερα στις 15 Μαρτίου 2015 με τραύματα από μαχαίρι, αντιμετώπιζε σε καθημερινή βάση ξυλοδαρμούς, χτυπήματα στο πρόσωπο και το σώμα, εξευτελισμούς, ενώ αναφέρεται και περιστατικό όπου τον κρέμασαν από παράθυρο του δεύτερου ορόφου της Σχολής. Οι ανατριχιαστικές περιγραφές της κόλασης με την οποία ήταν αντιμέτωπος ο Βαγγέλης Γιακουμάκης, καταγράφονται ως 23 περιστατικά κακοποίησης, τα οποία αποκάλυψε η αθηναϊκή εφημερίδα «Έθνος».
 
Μεταξύ άλλων, το χρονικό διάστηµα 2014 – 2015, αναφέρεται ότι σε διαφορετικά περιστατικά, ένας από τους κατηγορουμένους φέρεται ότι έριξε καυτό
νερό από σκεύος στον λαιμό του 20χρονου κατά τη διάρκεια διαλείμματος και ότι τον πάτησε με το τακούνι της μπότας του στα δάχτυλα του ποδιού. Ο συγκεκριµένος, µαζί µε άλλους τρεις συγκατηγορουµένους του, σύµφωνα µε τη δικογραφία, «κρέµασε µε τη βία και για αρκετή ώρα (τον Βαγγέλη Γιακουµάκη) από το παράθυρο του διαδρόµου, στον δεύτερο όροφο της Γαλακτοκοµικής Σχολής Ιωαννίνων».
 
Μετά τα μεσάνυχτα της 25ης Ιανουαρίου 2015, σημειώνεται ότι ένας από τους κατηγορούμενους φέρεται να κυνήγησε σε διάδρομο της εστίας της Σχολής, τον Βαγγέλη Γιακουµάκη κρατώντας ένα χοντρό κόκκινο ύφασμα το οποίο πέρασε στον λαιµό του θύματος σαν θηλιά. Τραβώντας τον βίαια προς τα πίσω, τον µετέφερε σε δωµάτιο και µαζί µε άλλους πέντε συγκατηγορουµένους του άρχισαν να τον χτυπούν, πετώντας τον µε δύναµη ο ένας πάνω στον άλλον και πάνω στην ντουλάπα του δωµατίου. Σε μιαν άλλη περίπτωση, ο ίδιος κατηγορούμενος, µε τη συνδρομή ακόμη τριών συγκατηγορουμένων του, αφού έπιασε µε τη βία τον 20χρονο, «βάζοντάς τον έτσι στο δωμάτιο του, τον έδεσε στο πάτωμα µε ένα μακρύ χοντρό σχοινί και τον χτύπησε επανειλημμένα στο πρόσωπο, τόσο µε τα χέρια του όσο και µε µια βούρτσα που γυαλίζουν τα στιβάνια (µπότες), προξενώντας του μώλωπες και εκδορές».
 
Το Νοέμβριο του 2014, δύο από τους κατηγορουμένους φέρονται ότι τύλιξαν πολλές φορές µε κολλητική ταινία το κεφάλι του Βαγγέλη Γιακουμάκη και τον χτύπησαν στην περιοχή των γεννητικών του οργάνων. Παράλληλα τον Ιανουάριο του ίδιου έτους, τέσσερις συγκατηγορούμενοι φέρονται ότι έριξαν τον 20χρονο στο κρεβάτι του και έπεσαν πάνω του χτυπώντας τον παράλληλα σε όλο το σώμα, προξενώντας του μώλωπες και παροδική ασφυξία. Έξι από τους κατηγορουμένους, ενώ βρίσκονταν στη Γαλακτοκοµική Σχολή Ιωαννίνων, τον ωθούσαν βίαια και «τον χτυπούσαν αιφνιδιαστικά και µε σφοδρότητα στον αυχένα, τον τράχηλο και το πρόσωπό του».
 
Μέσα στο πρώτο τρίμηνο του 2014, έξι κατηγορούμενοι φέρονται ότι κλείδωσαν µε τη βία και για πολλή ώρα τον Γιακουµάκη σε µια ντουλάπα που βρισκόταν σε δωµάτιο της εστίας της Σχολής και τον εξανάγκασαν να τραγουδά, ενώ του πετούσαν κέρματα. Στο τέλος της ίδιας χρονιάς, ένας κατηγορούµενος φέρεται πως εκσφενδόνισε από µικρή απόσταση τρία µήλα στο πρόσωπο του θύµατος και ένα από αυτά τον πέτυχε στο κεφάλι προξενώντας του µώλωπες.
 
Η δίκη των εννέα κατηγορούμενων ηλικίας 21 έως 25 ετών σήμερα, θα ξεκινήσει στις 8 Φεβρουαρίου 2019, για το αδίκημα της «επικίνδυνης σωματικής βλάβης από κοινού και κατά µόνας, κατ’ εξακολούθηση», με πέντε από αυτούς να ήταν ανήλικοι όταν τελέστηκαν τα αδικήματα. Τα περιστατικά κακοποίησης σημειώθηκαν εντός και εκτός της Σχολής από τον Ιανουάριο του 2014 έως τον Ιανουάριο του 2015. Για την υπόθεση έχουν σχηματιστεί ακόμη δύο δικογραφίες.
 
 Η µία αφορά την ποινική δίωξη για «παράβαση καθήκοντος» που ασκήθηκε ενάντια στο προσωπικό της Σχολής και στον πρώην υπουργό και βουλευτή Χρήστο Μαρκογιαννάκη. Ωστόσο, τον Ιανουάριο του 2018, ο πρώην διευθυντής της Σχολής καταδικάστηκε σε ποινή φυλάκισης 6 µηνών µε τριετή αναστολή και παράλληλα απαλλάχθηκε από την ευθύνη των εστιών της Σχολής ο κ. Μαρκογιαννάκης, ο οποίος ήταν κατηγορούµενος για «ηθική αυτουργία στην παράβαση καθήκοντος». Η δεύτερη δικογραφία αφορά την ποινική δίωξη που ασκήθηκε για «ανθρωποκτονία εκ προθέσεως» σε βάρος αγνώστου, μέχρι στιγμής, δράστη.